Їжа, що потрапляє в організм піддається механічній та ферментативній обробці, що є будівельним матеріалом для клітин і всього організму.
Візуалізація продуктів, що здійснюється органами зору та нюху першими спонукають на імпульси до головного мозку про вироботку ферментів та соків для подальшого перетравлення.
При ретельній механічній обробці їжі в ротовій порожнині харчовий комок потрапляє до шлунку, де під дією соляної кислоти білок розщеплюється на амінокислоти.У дванадцятипалій кишці ферментами підшлункової залози розщеплюються вуглеводи, а секрет жовчного міхура лізує жири.
Перетравлення, ферментація та всмоктування поживних речовин у тонкому кишечнику відбувається за рахунок ентероцитів, що вистеляють його слизову оболонку.
Перетравлена маса у вигляді детриту потрапляє в товстий кишечник, цей орган містить велику кількість мікроорганізмів, які допомагають організму в перетравленні. Деякі з них продукують вітаміни, які не містить не один з продуктів. Всмоктування води до 90% припадає на товстий кишечник.
Мікроскопічно, в нормі картина злагодженої роботи ШКТ та всього організму має вигляд детриту без домішків недоперетравленоі їжі.